Se você alterar sua resolução de tela nativa para qualquer tamanho de janela, a tela inteira terá / deverá ter o mesmo desempenho que a janela.
para esclarecer, o jogo rodando a 1680x1050 com janelas e tela cheia significa sua resolução nativa > = 1680x1050 ... provavelmente
Se algum aplicativo openGL aleatório tiver que renderizar uma viewport, dimensione-o ... o desempenho sofrerá.