Sem mais detalhes (como "Olive Twist" perguntou) é difícil dizer o que está errado. Você está vendo mensagens do kernel Oops?
Minha própria experiência mostrou que problemas de driver do X-Windows podem congelar o sistema Linux ou pelo menos congelar o console (mouse e teclado). (Mas estes são erros difíceis que impedem o sistema não o que você parece estar descrevendo)