Sem querer soar irreverente, é improvável que você precise de antivírus. A menos que você esteja em um ambiente realmente de alta sensibilidade, é improvável que você se depare com uma situação em que enfrentará um vírus do Linux. Em qualquer caso, eu recomendaria o ClamAV como um produto antivírus de código aberto. Você pode instalá-lo através de apt-get install clamav .
A maioria dos produtos antivírus que eu encontrei - particularmente o antivírus Sophos - só verifica vírus do Windows e, mesmo assim, só faz isso com o hash do arquivo. Isso significa que, se um vírus alterar até mesmo um byte no arquivo que o contém, o produto antivírus não pensará mais que é um vírus.