A hibernação é basicamente um instantâneo de um sistema operacional em execução, com todos os seus aplicativos em execução, arquivos abertos (talvez no meio de uma operação de gravação), caches de arquivos, etc.
Se você montar uma partição hibernada de outro sistema operacional e alterar dados no disco - o estado real do disco e o que o Windows sabe sobre o disco fica fora de sincronia, o que pode levar à corrupção grave do sistema de arquivos.
A resposta aceita em Não é possível montar o Windows (NTFS) sistema de arquivos devido à hibernação fornece mais detalhes.