Eu divido a janela do nautilus, abro pastas diferentes em cada parte e, em seguida, arrasto um arquivo da pasta à esquerda para a pasta à direita, a fim de movê-lo. Geralmente isso funciona bem, mas às vezes o arrastar é cancelado e nada acontece.
Eu uso mouse óptico padrão. Ainda não consegui reproduzir este bug de forma confiável. Alguma idéia?
Enquanto arrasta um arquivo / pasta para outra pasta, você deve esperar até que o ícone da pasta de destino mude: 
paraisso:
Note que seus ícones podem ser diferentes dependendo do seu tema, mas a idéia é, você deve esperar até que a pasta de destino responda ao seu arrastar.