Experimente estes comandos no terminal para corrigir a opacidade da barra de título:
gconftool-2 -s --type=bool /apps/gwd/metacity_theme_shade_opacity 0
gconftool-2 -s --type=bool /apps/gwd/metacity_theme_active_shade_opacity 0
Não tenho certeza sobre os efeitos de foco.