Uma incapacidade de acessar efisys ou procfs não deveria ter danificado o que estava lá antes, então a menos que esta falha tenha causado algum tipo de autodestruição suicida, o sistema ainda deve inicializar. OTOH, colocando meu chapéu cínico, não me surpreenderia muito se tal falha resultasse no pacote desinstalando arquivos críticos ...
De qualquer forma, se o seu sistema realmente não puder ser inicializado, minha recomendação é instalar manualmente um carregador de boot usando um disco de inicialização de emergência. Você deve ser capaz de instalar o pacote grub-efi-amd64 do Ubuntu através de pelo menos dois métodos (usando a opção --root para dpkg em uma inicialização de emergência ou fazendo o chrooting em seu sistema regular e usando dpkg ou apt-get um caminho normal). Como alternativa, você pode instalar qualquer carregador de inicialização EFI que deseje testar por meio de métodos que não sejam gerenciadores de pacotes. Normalmente, você só precisa copiar um punhado de arquivos para a partição de sistema EFI (ESP) e configurar um arquivo de configuração ou dois. Existem quatro opções principais (em ordem de confiabilidade, elas são o carregador stub EFI do kernel no kernel 3.3.0 e posterior, ELILO, GRUB Legacy e GRUB 2). Veja minha página na Web sobre o tópico para mais informações sobre tudo isso; há muito a dizer sobre eles para caber em uma resposta aqui.