Acho que isso pode ser mais um problema de hardware.
Como você disse, você teve o mesmo problema ao usar o Windows, por isso não é específico do Ubuntu. Silenciar o Mic pode consertá-lo, mas não é realmente uma cura.
Outros usuários com o mesmo modelo de laptop têm algum problema?
EDIT: Um rápido google sugere que este laptop modelo tem um "gemido de CPU" perceptível