você pode inadvertidamente ter alterado a propriedade desses arquivos para algum outro usuário do sistema (root, ou algo assim)
Normalmente, corrijo isso abrindo uma janela de terminal e fazendo algo como:
cd /home/ccrama/
sudo chown -R ccrama *
Cuidado: você não quer fazer isso em nenhum lugar fora do seu diretório pessoal, pois isso pode atrapalhar as coisas.
Se você não souber o que esses comandos fazem, digitar "man" na linha de comando abrirá a documentação para esse comando:
man chown