Eu duvido seriamente que o Wine tenha alguma coisa relacionada ao seu problema de inicialização, a única possibilidade que o Wine tem de carregar qualquer coisa é depois que o usuário faz o login.
De qualquer forma, se você quiser remover o Wine, siga as instruções abaixo.
Inicialize até a tela de login, em vez de inserir suas credenciais de usuário, pressione Ctrl + Alt + F1 para alternar para um TTY (pressione Ctrl + Alt + F7 para voltar para sua sessão X em execução).
Faça login no TTY e use esses comandos para remover o Wine do seu sistema:
Remover vinho
sudo apt-get remove --purge wine
Move o cache do Wine para outro lugar
move ~/.wine ~/wine.old
Reinicie
sudo reboot
Isso deve ser suficiente para remover qualquer vestígio de vinho do seu sistema.