Se você quer dizer "conectando do remoto" como uma solução de área de trabalho remota, então sim, isso não é necessário. Você precisa sincronizá-los de alguma forma e temos soluções para isso. Por exemplo, o Ubuntu One pode ser usado para sincronizar arquivos entre computadores. Existe também algo chamado OneConf que pode ser usado para sincronizar as configurações do aplicativo, etc.