A resposta é voltar para 1.x já que várias bibliotecas / ferramentas são compartilhadas entre outros programas que o VLC usa.
Para resolver isso primeiro:
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Remova o PPA do VLC 2.X de suas Fontes de software
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Execute isto no terminal para remover qualquer vestígio de VLC 2.X:
sudo apt-get purge vlc libvlc5 libvlccore5 vlc-data vlc-nox vlc-plugin-notify vlc-plugin-pulse
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Atualizar repositórios:
sudo apt-get update
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Instale o VLC 1.x:
sudo apt-get install vlc
Eu sinto muito por ter que perguntar e responder a isso, mas para fazer alguma ajuda sobre isso com vários amigos e usuários aqui, achei que seria melhor colocá-lo agora do que esperar. Espero que ajude qualquer pessoa que atualize para o VLC 2.xe encontre problemas depois.