Você atualizou para o Gnome 3 e seu painel tem a aparência que deveria. É configurável, como a versão anterior, mas ainda não tem muitas ferramentas de configuração. Você pode usar o dconf-editor de dconf-tools , mas não é muito fácil de usar.
Ele é incompatível com o Gnome 2, portanto você não terá esses applets, embora alguns possam ter sido portados. O Gnome 2 foi preterido (pelo Gnome, não pelo Ubuntu) e não estará disponível em nenhuma versão futura. Se você quiser usar o Gnome 2, você provavelmente deve usar 10.04 ou talvez 11.04. 10.04 é suportado um pouco mais, no entanto.