Acho que o cenário A e C é o caminho a seguir.
Você pode se conectar ao sistema Alternativas e adicionar a entrada relevante ao Sistema → Preferências → Padrão Tela de aplicativos, assim:
Acredito que configurar-se como padrão na instalação é bom, no entanto. Exibir um aviso na primeira execução perguntando se cada usuário deseja usar o padrão anterior seria bom.
(É possível adicionar uma nova entrada nesse diálogo?)