Instale o carregador de boot do GRUB no seu MBR, não para uma partição. [i.e. para / dev / sda em vez de / dev / sda3 ]
Você ainda pode inicializar o Windows a partir do Grub, e você pode até mesmo reinstalar o gerenciador de inicialização do Windows no MBR inserindo o disco do Windows 7, selecione reparar e ele detectará automaticamente o carregador de inicialização ausente e o instalará.
Edit: Eu olhei para os seus comentários, você tem uma unidade física separada para o Ubuntu ou apenas uma partição? Se você tiver um disco rígido físico separado, precisará instalá-lo no disco rígido do Windows ou alterar a ordem de inicialização dos discos rígidos no BIOS para que o disco do Ubuntu seja primeiro .
Editar 2: Eu não disse isso, mas também sugeri que você também instalasse o GRUB no MBR da sua unidade Ubuntu, além de configurá-lo para inicializar a partir dele primeiro.