A solução foi usar 10.04 LTS.
Estou lutando com o Ubuntu 11.10 por alguns dias, resolvi a maioria dos problemas, como se livrar do Unity e instalar o Kde.
Mas há um problema com o áudio.
Meu PC tem uma placa de áudio X-Fi conectada ao receptor digital por um cabo óptico, que sempre funcionou. O Windows estava enviando som codificado DTS 5.1 através do cabo óptico, e todos os 6 canais funcionavam como esperado.
Consegui também fazer o som funcionar no Ubuntu, selecionando "Master Channel - IEC958", que reproduz som estéreo através do receptor digital 5.1, e funciona na maioria das aplicações - Firefox + Flash, VLC, Shell. Mas o Skype é totalmente silencioso.
Por padrão, ele é deixado no "dispositivo padrão", mas parece não funcionar em nenhuma das 30 opções de dispositivos oferecidas pela tela de opções do Skype.
Estou completamente perdido e não tenho mais ideias sobre onde procurar e como resolver o problema ...
Alguém pode me dar um conselho sobre onde procurar em seguida?