Não há plugin que faça isso. Isso ocorre porque o Eclipse nunca foi feito para essa finalidade e, portanto, não inclui todos os detalhes do Ubuntu Packaging. Qualquer plug-in que possa fazer isso seria, na melhor das hipóteses, incompleto e provavelmente estragaria o pacote de uma maneira que viole o pacote Debian.
(o Ubuntu é baseado no Debian, e usa os formatos de pacotes .deb do Debian: P)