Eu sugiro que você tente utilitários de verificação do sistema de arquivos .. "fsck" a partição / volume em que o arquivo criptografado reside. Você pode precisar inicializar um LiveCD ou algo para fazer essa verificação. Depois disso, tente descriptografar seu arquivo novamente. Se isso não funcionar, temo que você seja SOL. Mas talvez os outros saibam truques.
Boa sorte, amigo!