Eu tive o mesmo problema e consegui corrigir a mensagem de erro, mas ainda não tenho o indicador do touchpad funcionando corretamente.
Descobri que depois da minha atualização para 11.10 o atalho que eu tinha em 11.04 ainda estava lá, mas apontando para o diretório errado.
Eu fui para Configurações do sistema > Teclado > Atalhos e desmarquei meu atalho que estava em Personalizado. Isso corrigiu a mensagem de erro, mas o recurso de atalho no Touchpad-Indicator não funciona.