Esta não é uma resposta direta, mas eu tive um problema semelhante com 11.10. A correção desenvolvida por Seth Forshee disponível no link resolveu meu problema e também funcionou para MUITA pessoas.
Vale a pena conferir e perguntar sobre isso. Definitivamente pode ser a solução se a saída de xinput list
no shell mostrar que você tem um Alps TouchPad .