O Tasktop funcionará muito bem no Ubuntu. O Tasktop é construído sobre o Eclipse, que se destina a ser completamente multi-plataforma. (O Eclipse provavelmente não funcionará no Commodore 64s, mas funcionará em praticamente todas as principais plataformas contemporâneas.)
Eu não tentei por um tempo, mas eu corri o Eclipse 3.3 e o Mylyn no meu laptop Hardy Heron regularmente, dois ou três anos atrás. (Eu corri o dia todo na minha máquina SUSE de trabalho.)
Aviso: recentemente, comecei a trabalhar para o Tasktop. Eu não fiz dois ou três anos atrás.