Existem algumas coisas que podem limitar sua velocidade:
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O servidor de recebimento: alguns servidores limitam / velocidades de download dependendo do protocolo usado (por exemplo: eu costumava ter um servidor de hospedagem na Web que acelerava os downloads HTTP para 40 KB / s, mas o SCP funcionava a toda velocidade)
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Seu ISP (ou seja: seu limite de velocidade upstream): se este for o caso, a única opção é atualizar
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Seu cliente (FileZilla): se você pode fazer o upload com melhores velocidades para o mesmo servidor usando o mesmo protocolo com um cliente diferente, pode ser uma configuração em seu cliente.