Ok, eu descobri uma solução para mim. Executar:
redshift -m randr:crtc=2 -O 9000
para o terceiro monitor do redshift-disabled (às vezes eu uso 8000).
E corra
redshift -m randr:crtc=0 -O 3000
redshift -m randr:crtc=1 -O 3000
É a minha temperatura de cor para os outros monitores.