Você desejará usar um partman-auto / expert_recipe, mas altere os atributos da partição que não deseja que sejam formatados para o método {keep}. Você precisa remover o formato {}, sistema de arquivos {} e use_filesystem {}.
Você também desejará adicionar as seguintes linhas ao seu arquivo de pré-configuração:
partman-basicfilesystems partman-basicfilesystems/no_mount_point boolean false
d-i partman-partitioning/confirm_write_new_label boolean true
d-i partman/choose_partition select finish
d-i partman/confirm boolean true
Aqui está um link para o arquivo preseed do para o Ubuntu 12.04 . Exemplo de configuração está incluído para vários tipos de configurações.