Não é exatamente o que você pediu, mas, ainda assim, para distinguir entre janelas focalizadas e de fundo, você pode usar o efeito de borrão para janelas de fundo. Para conseguir isso, você pode usar uma extensão do shell do GNOME chamado Efeitos do Windows Blur . Você pode alterar a dessaturação, brilho e contraste das janelas de fundo usando esta extensão.
(fonte da captura de tela: homepage da extensão em extensions.gnome.org)