Não vai estragar tudo, eu recomendo fazê-lo assim, eu estou atualmente executando o Windows 10 no UEFI e Ubuntu 17 no legado e tudo funciona bem, meu BIOS do laptop permite-me escolher qual deles para ser executado por padrão Eu posso escolher o que eu uso principalmente a qualquer momento e não me preocupo com a escolha do SO toda vez que ele é iniciado.