É difícil responder à sua pergunta sem conhecer os detalhes (por exemplo, quais pacotes de terceiros você usa, quais configurações de recuo padrão). Você nem mencionou como a indentação difere entre os editores.
No entanto, geralmente recomendo usar o EditorConfig , que permite definir regras de recuo (entre outras) para um projeto. Sobre cada editor principal suporta o EditorConfig através de plugins (incluindo Sublime Text e Código do Visual Studio ). É especialmente útil para equipes que usam vários editores diferentes.
Para o Python, o arquivo .editorconfig do Django é um bom ponto de partida. Coloque-o na raiz do seu projeto e agora todos os editores com suporte ao EditorConfig respeitarão essas regras.