O terminal padrão que está sendo usado no Ubuntu é na verdade destinado ao ambiente Gnome, onde você pode ver as principais barras de menu de aplicativos que você está executando constantemente. No entanto, Unity - o ambiente padrão no Ubuntu, sempre auto oculta Menubars.Assim, a opção "Show Menu Bar" é útil quando no ambiente Gnome, e como você afirmou não faz qualquer diferença no Unity.