Mudar seu bootloader de volta para o MBR do Windows deve permitir que você inicialize o Windows normalmente.
Tente usar o Lilo. Instale o Lilo entrando no terminal do Ubuntu
sudo apt-get install lilo
e assim que estiver instalado, digite este comando para restaurar o gerenciador de inicialização do Windows:
sudo lilo -M /dev/sda mbr
Agora, quando você inicializar a unidade de 1 TB, ele deve carregar o Windows normalmente.
Boa sorte