Parece que encontrei uma solução alternativa (pelo menos por enquanto): adicionando o vers = 2.0 (ou 1.0, mas isso tem outras desvantagens, como links simbólicos que não funcionam).
Em outras palavras, com a seguinte linha, as transferências de arquivos estão de volta à velocidade máxima:
//server/share /media/server cifs vers=2.0,credentials=/home/me/.smbcredentials,file_mode=0777,dir_mode=0777
Não sei por que ele quebra com a versão 3. Seria ótimo se alguém pudesse ajudar a explicar:)