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Desenvolvedor Rufus aqui. Eu posso dizer com certeza que nenhum dos arquivos do isolinux / syslinux que o Rufus carrega acaba sendo transferido para o sistema que você está instalando (e eles não são bibliotecas do Linux para começar!). Eles só estão sendo baixados para que o isolinux / syslinux possa inicializar o USB. Caso contrário, você receberia um erro durante a inicialização, muito antes de conseguir instalar qualquer coisa.
Os próprios instaladores não sabem e não se importam nem um pouco com esses arquivos baixados e, como residem fora do local de onde o conteúdo é copiado, posso afirmar com 100% de certeza que o seu libllvm4.0
, ou qualquer outra biblioteca que você ache que tenha sido instalada inadvertidamente, não venha do uso do Rufus.