Você pode estar perdendo o pacote unity-gtk2-module
sudo apt-get install unity-gtk2-module
Ou pode ser instalado errado
sudo apt-get install --reinstall unity-gtk2-module
Além disso, certifique-se de reiniciar ou efetuar logout para garantir que tudo funcione corretamente. Talvez você não precise fazer isso, basta reiniciar o programa.