O meu problema é muito semelhante ao problema 992536, no qual não foi dada nenhuma solução. Eu instalei o Ubuntu 16.04 e tudo funcionou até que eu fiz as atualizações. Eu reinstalei e o problema voltou depois de executar as atualizações. O problema é:
Quando eu clico no iniciador do Unity ou clico nos ícones, ele desaparece por um momento e a tela vai para a tela do papel de parede por um momento, então tudo volta. Faz a mesma coisa quando eu vou desligar ...
Eu consegui resolver 90% do problema, marcando a opção "Ativar modo de baixo nível de gráficos" no CCSM. O lançador não desaparece mais quando eu passo o mouse sobre ele ou clico nos ícones. O único problema que parece persistir é clicar no HUD ou tentar desligar.