Uma pergunta semelhante já foi feita sobre este assunto: É possível "atualizar" de uma instalação de 32 bits para uma de 64 bits?
Como foi explicado, a atualização do Ubuntu (32-bit) para o Ubuntu (64-bit) é para sysadmins de nível profissional , portanto, eu recomendo que você seja muito cuidadoso com isso. ( sistemas baseados em Debian de 32 bits a 64 bits ).
Portanto, se você tiver uma partição / home separada, a solução mais fácil seria sobrescrever a partição / fazendo uma instalação do Ubuntu 16.04 (64 bits) sobre isso.
Dito isso, se você realmente quiser fazer a migração e não tiver uma partição / home , há uma maneira simples para fazer essa migração : Quora - Migração 32 bits a 64 bits
P.S. Se você não se importa em perder todos os seus dados, você deve então instalar o Ubuntu 16.04 (64 bits), será a maneira mais rápida e fácil possível.