A maneira mais simples de conseguir isso é com tags, não eventos. A resposta curta é importar manualmente pasta por pasta e marcar cada lote de importações.
A primeira decisão que você deve tomar é preservar sua estrutura de diretórios e manter fotos em pastas como as que você tem agora. Shotwell padrão para uma estrutura de diretórios de data, você tem uma estrutura de eventos.
Se você não se importa, tenha todas as fotos fora / Pictures e importe uma pasta de cada vez usando File / Import from folder .... Marque cada lote como você vai. Todas as suas fotos serão reorganizadas em / Imagens com base em datas.
Se você quiser manter a estrutura do evento, desmarque a opção "Assista ao diretório da biblioteca para novos arquivos" em Editar / Preferências / Biblioteca. Mova todas as pastas com fotos para / Pictures. Em seguida, importe um de cada vez, marcando novamente cada lote de importações. Você terá que manter a biblioteca a partir de então, importando manualmente as fotos.