Existe um pergunta perguntando algo semelhante em relação ao tema GTK3.
Eu usei a resposta abaixo quando queria exceto que o VLC assumisse um tema sombrio .
O que eu estou perguntando aqui está relacionado ao uso do Unity com os ícones padrão Ubuntu Unity (ubuntu-mono-dark, embora alterados com folder-color): Eu gosto de Unity com padrões, gosto de mantê-los, mas não gosto a aparência muito colorida dos botões de alguns aplicativos como o Audacious, botões que vêm do tema principal do ícone.
EugostariadeusaralgunsíconesmonocromáticoscomooPapirus,masapenasparaaplicativosespecíficos.ComPapirus,Audaciouspareceassim:
mas eu não quero usar ícones do Papirus para todo o sistema.