Se você estiver usando o VLC, é melhor usar o > Preferências > Áudio > Efeitos > Ativar áudio de alongamento de tempo - desmarcado (o padrão está marcado) e talvez módulo de saída: saída de memória de áudio (o padrão é Automático). É alguma coisa de configurações, mas eu não descobri isso ainda. Qualquer nova tentativa e erro é muito bem-vinda. (Estou usando o VLC 2.2.2 no eOS Loki, baseado no Ubuntu 16.04)