Todos os arquivos criados durante uma sessão ao vivo do Ubuntu devem ser armazenados fora desta sessão ao vivo se quisermos mantê-los.
Por isso, você deve instruir os usuários sobre como montar uma unidade interna ou externa existente ou um pendrive para armazenar seus dados. Isso pode até ser uma partição adicional na unidade USB da qual você havia inicializado o sistema, mas não pode ser a unidade virtual que foi criada pela sessão ao vivo.
Se essa unidade foi formatada com um sistema de arquivos Linux, você precisa cuidar das permissões de arquivo. Armazenar arquivos em um sistema de arquivos do Windows (por exemplo, NTFS, FAT32) não terá problemas de permissão.