A hora do meu sistema em uma instância do EC2 do Ubuntu parece continuar mudando, alguns minutos por mês, depois de 4 meses eles mudaram tanto que as chamadas para a API da AWS estão falhando. O hwclock parece bem - não deslocado, e reiniciar o servidor parece resolvê-lo (desloca a hora do sistema de volta para a hora correta, correspondendo hwclock)
Reiniciar o servidor automaticamente uma vez por dia parece um pouco excessivo, então um cron job para sincronizar automaticamente a hora do sistema do hwclock seria um patch aceitável até que eu possa atualizar os servidores para o ubuntu mais recente em poucos meses (que pode ou não resolvê-lo, mas vamos ver então).