Não saiba realmente se isso ajuda:
Problema de permissão: você deve fazer as operações apt como root ou sudoer, por exemplo:
- logar como root (perigoso)
- tornou-se um sudoer e então você pode escrever o comando desta maneira:
$ sudo apt-get update
Outro problema com erros / avisos semelhantes: você não pode executar apt operações simultaneamente = verificar se você tem algum outro processo apt em execução - em outro console pode executar aptitude , em Xwindows executa Synaptics . Os outros processos bloqueiam as bibliotecas necessárias, listas de pacotes, etc.
Boa sorte