Aqui está o meu 30-libinput.conf para referência.
Section "InputClass"
Identifier "touchpad"
Driver "libinput"
MatchIsTouchpad "on"
Option "Tapping" "on"
Option "DisableWhileTyping" "on"
Option "TappingDrag" "off"
Option "NaturalScrolling" "on"
Option "TappingDragLock" "off"
EndSection
A única diferença que posso ver é a ordem das opções e o fato de você ter capitalizado a palavra Touchpad no bit Identificador. Pode ser algo tão bobo quanto isso. Eu tive Linux se recusar a arrancar com um arquivo de configuração libinput configurado incorretamente antes de eu chegar a este. :)
Nota: Eu olhei apenas para o sistema fornecido 40-libinput.conf e os identificadores são todos em minúsculas, então poderia ser isso.