O utilitário xinput fornece um utilitário para configurar e testar dispositivos de entrada X. Faça um man xinput para detalhes. Você pode usar xinput list para obter uma lista dos dispositivos em seu sistema. xinput --disable 'ELAN Touchscreen' desativará um ELAN Touchscreen e xinput --enable 'ELAN Touchscreen' reativará o mesmo dispositivo.
Para realmente criar um botão de alternância, você pode ajustar a resposta para this pergunta e colocar o script resultante em um arquivo .desktop.