Eu tive várias experiências em que terminal
não abriria. Para contornar isso, criei um atalho de teclado com dbus-launch gnome-terminal
Talvez a criação de um atalho semelhante para o nautilus pudesse remediar o problema?
dbus-launch nautilus
Você pode tentar em um prompt de comando e ver se isso é uma correção de ponte para você.