Receio que não exista uma solução pré-existente.
Para a "combinação de chaves secretas", consulte [ícone do gnome] → Centro de controle → Combinações de teclas. Realmente, qualquer coisa com uma letra + de controle provavelmente estará a salvo de uma criança.
Para desabilitar chaves, o xmodmap é provavelmente sua melhor aposta. Veja como definir F1..F3 para imprimir o período ou o número correspondente, dependendo do estado "shift" ...
xmodmap <<EOX -
keycode 67 = period 1
keycode 68 = period 2
keycode 69 = period 3
EOX
(dessa forma eles fazem "algo", nada engraçado).
E isso é bom para "criança pequena vem junto, quer brincar com o teclado". À medida que envelhecem, precisam de uma conta própria.