Se eu rodar o Ubuntu com o Xorg, o docky funciona bem.
Tenho alguns problemas com a minha configuração Docky em 17.10. Nenhum ícone de aplicativos do sistema é exibido. i.g. Console, Nautilus ... Se fixar o console e executá-lo, nenhum ponto "em execução" será exibido. No modo de depuração, recebo "Aviso: DESKTOP_STARTUP_ID não definido e não há fallback disponível".