Quando usei o Windows, eu pude iniciar a transferência de arquivos pelo samba e limitar sua velocidade usando a fila de transferência no Total Commander (eu também poderia pausá-lo).
Existem algumas alternativas ao Total Commander for Ubuntu (por exemplo, Double Commander), mas nenhuma delas pode limitar a velocidade de transferência do samba. (Em particular, Double Commander, se não me engano, permite limitar a velocidade de transferência de arquivos, mas apenas para transferências locais, não para aquelas feitas através de LAN.)
Você conhece um gerenciador de arquivos GUI que possui esse recurso? (Eu não consegui encontrar um.) Eu gostaria de enfatizar que eu não quero limitar toda a velocidade da conexão LAN, apenas para transferências selecionadas de minha escolha (a escolha é feita quando eu começo uma transferência).