Consegui usar a GUI para me conectar a uma Juniper VPN. Para fazer isso, instalei o seguinte pacote:
sudo apt-get install network-manager-openconnect-gnome
Então, ao acessar as configurações da VPN, no Add VPN (+), há uma nova entrada "Cisco Compatível com VPN AnyConnect (openconnect)" que permite conectar a um dispositivo da Juniper.