Antes de mais nada, exatamente como @ user535733 sugerido, tente verificar seu disco rígido em busca de problemas de saúde. Você pode experimentar o HDSentinel, eles têm uma versão gratuita do linux e eu achei muito bom: link , a abordagem mais segura seria executá-lo no Ubuntu LIVE USB para garantir que operações / serviços normais do sistema não afetem o disco leituras / gravações (isso pode acontecer se você tiver algum software de indexação em execução (por exemplo, digikam ou similar)
Em seguida, faça backup de todos os dados no disco rígido externo, reinstalando o sistema de forma adequada, formatando a partição e instalando o sistema do zero. Se não tiver certeza sobre o que está fazendo, faça backup do Ubuntu e do Windows aconselhado, mesmo se você acha que sabe)
Em seguida, você pode executar o Ubuntu USB ao vivo e instalar a partir daí. Certifique-se de selecionar o tipo de instalação correto durante o assistente do instalador:
Se você estiver nessa etapa, poderá selecionar sua partição antiga como uma partição principal do ubuntu sem formatar a partição do Windows.
Durante a instalação normal do Ubuntu, o Grub se encarregará de adicionar partições do Windows de volta ao menu de inicialização.