As extensões mencionadas são antigas e não são mais atualizadas para versões mais recentes do Gnome Shell. Você deve removê-los.
Por padrão, o Gnome Shell deve ser capaz de fornecer resultados de pesquisa do rastreador. Para isso, ele conta com a pesquisa Nautilus, que por sua vez pode usar o rastreador. É muito possível que, na prática, a pesquisa de texto completo por meio do Gnome Shell ainda não funcione. Afinal de contas, é só a partir de alguns meses que a pesquisa baseada em nomes de arquivos simples começou a funcionar no Gnome Shell, vindo com o Ubuntu 18.04.