Espero que isso funcione também em 16.04, estou trabalhando no Ubuntu 17.10. Eu tive o mesmo problema até que percebi que eu posso acessar outras unidades a partir da raiz. Faça o seguinte: em Mendeley, clique na pasta watch e siga este caminho:
/ >> media >> [username] >> [Drive]
-
[username]é o seu nome de usuário no computador. -
[Drive]é o nome do Drive que você está procurando.
Minha unidade adicional estava lá e está funcionando para mim.